По иронии судьбы в разные годы Спасо-Преображенский собор служил площадкой для Антирелигиозного музея, а впоследствии Музея истории религии и атеизма. Возможно, именно они стали для храма спасательным кругом в бушующем море взглядов «союза безбожников».