Зоологический музей Днепровского национального университета был основан в 1901 году. Идея его создания принадлежала историку Дмитрию Яворницкому. Сначала экспозиция была частью Краеведческого музея, а в 1924 году переехала в один из учебных корпусов ДНУ, став самостоятельным учреждением.