Фильм начинается с загадочного исчезновения частного детектива Гарри Гудмана. После этого, его 21-летнему сыну Тиму предстоит выяснить, что произошло с отцом. В этом Тиму поможет Покемон детектив Пикачу, милый и мудрый остряк, который порой является загадкой даже для себя самого.
Том и Пикачу вместе отправляются в невероятное приключение. Они ищут ключ к разгадке в неоновом мегаполисе Райм-сити, где люди и Покемоны живут бок о бок. Том и Пикачу знакомятся с различными покемонами и узнают шокирующую правду, способную положить конец мирному сосуществованию и поставить под угрозу весь мир Покемонов.